プラグインの表示順番は、プラグイン管理画面で順番を変更できます。
日本語拡張版に標準配布のカスタムメニュープラグイン(custommenu)を活用すると自由度の高いメニューを設置できます。
高度な多階層メニューはナビゲーションプラグイン(navman)を活用してください。